Czynności w grze ograniczają się podstawowo do stereotypowych zadań Ninji - misji. Oczywiście można uciec, stać się złym, przystąpić do Akatsuki lub inne takie rzeczy, jednak podstawowo musimy wykonywać misje. Misje dzielą się na 5 kategorii, zależy od nich stopień ich zaawansowania oraz wymagania osoby która ma to zadanie wykonać. Zadania dzielą się na:

D- zadania wykonywane tylko przez Geninów, ograniczają się do przyziemnych pomocy ludziom np. posprzątaj, usuń chwasty z ogródka, znajdź kota itd.
nagroda wynosi od 50 - 250 Exp.

C - zadania dla Geninów i Chuninów, polegają często na eskortowaniu ludzi lub szukaniu ważnych rzeczy, np. skarbów lub starych zwojów.
nagroda wynosi od 150 - 750 Exp.

B - zadania dla Chuninów i Joninów. Najczęściej są to misje podobne do misji rangi C, jednak jest w nich niebezpieczeństwo walki na śmierć i życie, taka misja może równie dobrze zmienić się nagle w misje rangi A.
nagroda wynosi od 500 - 1250 Exp.

A - Zadanie zalecane dla Joninów, gdyż Chunini są często za słabi. Są to misje wyjątkowo niebezpieczne dla życia, polegają często na sabotażach wrogów lub innych wyjątkowo niebezpiecznych rzeczach.
nagroda wynosi od 750 - 2500 Exp.

S - Rzadkie misje, wykonywane przez Kage, Sanninów lub bardzo doświadczonych Joninów. Są to często starcia z innymi wioskami, organizacjami lub przeciwko innym potężnym osobom.
nagroda wynosi od 2500 - [nie ma górnego progu] Exp.